Ostrea新宿三丁目店の店内は、木のぬくもりが感じられるスタイリッシュなデザインで、カウンター席と、テーブル席があります。テーブル席には赤と白のチェックのテーブルクロスがかけられ、どことなくイタリアンなムードが漂っています。店内の一角にはガラスケースがあり、その中には世界中の豊富な種類の牡蠣がたくさん並んでいます。棚の上には、数々のワインのボトルが並び、ちょっとしたバーのような雰囲気もあります。
美味しく新鮮で安全な牡蠣を提供するために、独自に研究開発した「BOKFS」という鮮度を維持するためのシステムを採用しています。牡蠣を安全に輸送するために「スラリーアイス」という独自の氷も採用しているのです。スラリーアイスはブロック氷よりも溶けにくく、氷粒子が細かく食物全体を包み込む特性があり、海産物の鮮度や美味しさを維持し、牡蠣の旨味をさらに増す効果もあり、身割れや氷焼を防ぐ効果もあります。
Ostrea新宿三丁目店では、スパークリングワインや赤ワイン、白ワイン、シャンパンなど、新鮮な魚介類にとてもよく合うアルコールメニューも豊富に用意されているのです。ワインに関しては世界中のワインから国内産の様々なワインまでラインナップも豊富に揃っています。また、ビールや日本酒などの取り揃えもあります。